大通草和小通草在来源、药材性状、功效、价格等方面存在明显区别，且各有特点，并无绝对的好坏之分。具体如下：
一、来源不同：
1.大通草来源于五加科植物通脱木的干燥茎髓。
2.小通草为旌节花科植物喜马山旌节花、中国旌节花或山茱萸科植物青荚叶的干燥茎髓。
二、药材性状有差异：
1.两者都呈圆柱形且颜色为白色或淡黄色，大通草直径通常为1至2.5厘米，有空心。
2.小通草直径在0.4至1厘米之间，无空心。
三、功效各有侧重：
1.两者均有清热、利尿、下乳的功效。
(1)大通草主要侧重于通经下乳的治疗，常用于产后乳汁不通。
(2)小通草通乳作用较弱，更侧重于利尿通淋的作用。
四、价格不同：
1.大通草价格相对较高，市场价格大概在200到300元一公斤。
2.小通草价格相对较低，因其功效与大通草有相似之处，所以常有人用小通草替代大通草，价格多在几十元到上百元不等。
服用这些药物需要在医生指导下进行，切勿自行用药。总之，大通草和小通草虽有诸多不同，但在各自适用的病症中都能发挥重要作用。