大通草和小通草同属旌节花科植物，都有通乳下奶的功效，但在植物形态、功效主治、用法用量等方面有一定区别。
一、植物形态
1.大通草：茎髓呈圆柱形，长20-40cm，直径1-2.5cm，表面白色或淡黄色，有浅纵沟纹。质柔软，能轻易折断，断面平坦，显银白色光泽，中部有直径0.3-1cm的空心或白色半透明的薄膜。气微，味淡。
2.小通草：茎髓呈圆柱形或扁圆形，长5-30cm，直径1-2cm。表面白色或淡黄色，无纵沟纹，体轻，质松软，稍有弹性，易折断，断面平坦，无空心。气微，味淡。
二、功效主治
1.大通草：具有清热利尿、通气下乳的功效。用于治疗湿热尿赤、淋病涩痛、水肿尿少、乳汁不下、经闭带下等病症。
2.小通草：具有清热、利尿、下乳的功效。用于治疗泌尿系感染、尿闭、乳汁不下等病症。
三、用法用量
1.大通草：内服，煎汤，3-9g；或入丸、散。外用，适量，研末调敷。
2.小通草：内服，煎汤，2-5g；或入丸、散。外用，适量，研末调敷。
综上所述，大通草和小通草的区别主要在于植物形态和功效主治方面，在临床应用中应根据具体病症选择合适的药材。需要注意的是，两者均为下品药材，孕妇应慎用。