卵巢囊肿5cm且怀孕了，可先密切观察。卵巢囊肿有生理性和病理性之分，是卵巢出现囊性结构，可能无症状，也可能有腹部胀痛不适，还易有蒂扭转、囊肿破裂、感染等风险。生理性及部分病理性囊肿即使5cm也不影响怀孕，但若是恶性肿瘤则需积极处理，可能要终止妊娠。
一、生理性卵巢囊肿：
1.黄体囊肿：因排卵后血液流入黄体腔形成，一般怀孕3个月后逐渐被吸收，无需治疗，密切观察即可。
2.卵巢滤泡囊肿：由卵泡上皮病变致卵泡液未完全吸收或增多形成，也无需治疗，怀孕时不必过于担心，密切观察就行。
二、病理性卵巢囊肿：
1.巧克力囊肿：由子宫内膜在卵巢内生长形成，怀孕后即使5cm也无需过于担心，可密切观察。
2.畸胎瘤：多为良性，病变率低，即使5cm也可继续妊娠，对怀孕影响不大。
3.恶性肿瘤：建议尽快手术治疗，可能需遵医嘱终止妊娠，以免延误最佳治疗时间致转移、扩散风险。
如果孕期发现卵巢囊肿5cm，要做肿瘤标记物、超声检测，必要时做CT等相关检查以明确是否有恶性肿瘤存在。若女性出现腹痛、出血等问题，应及时就医并针对具体情况进一步治疗。
总结：对于怀孕且有5cm卵巢囊肿的情况，要分清类型，生理性和部分病理性可观察，恶性肿瘤需及时处理，同时要做好相关检查和应对出现的问题。