葡萄胎的发生原因目前尚不完全明确，一般认为可能与以下因素有关。首先是营养因素，比如饮食中缺乏维生素A以及胡萝卜素和动物脂肪，可能会增加葡萄胎发生的风险。有研究显示，在以大米和蔬菜为主食的地区，葡萄胎的发生率相对较高。
染色体异常因素
完全性葡萄胎： 染色体核型大多为二倍体，全部染色体来自父系，常见的是46XX，是由一个细胞核基因物质缺失或失活的空卵与一个单倍体精子（23X）受精，然后精子的染色体发生复制变为二倍体（46XX）所导致。部分性葡萄胎： 染色体核型多数为三倍体，最常见的核型是69XXY，是由一个正常卵子与两个精子受精，或者是由一个正常精子与减数分裂失败的卵子受精所形成。
内分泌失调因素
卵巢功能不全： 女性的卵巢功能如果出现不全，会影响激素的正常调节。比如卵泡发育不良等情况，可能使得雌激素分泌不足，从而影响子宫的正常发育，增加葡萄胎发生的几率。一般认为，卵巢功能低下的女性，发生葡萄胎的风险比正常女性要高一些。垂体分泌功能异常： 垂体分泌的一些激素对于维持正常的妊娠过程起着重要作用。如果垂体分泌的激素失衡，比如促性腺激素等分泌异常，就可能干扰胚胎的正常发育，导致葡萄胎的形成。有研究发现，垂体功能异常的女性，葡萄胎的发生率相对有所升高。
营养缺乏与社会经济因素
营养缺乏： 前面提到饮食中缺乏维生素A及胡萝卜素和动物脂肪，会增加葡萄胎风险。例如，长期素食且不注意补充相关营养物质的人群，患葡萄胎的可能性相对较高。社会经济因素： 经济状况较差的地区，人们的营养摄入往往不够均衡，更容易出现营养缺乏的情况，从而使得葡萄胎的发生率相对较高。比如一些贫困地区，由于食物种类单一，难以保证维生素等营养物质的充足摄入，葡萄胎的发病风险可能会增加。