五岁孩子出现头疼、肚子疼的原因包括胃肠炎、胃肠型感冒、脑炎、植物神经紊乱等，家长应及时带孩子就医明确诊断。
一、胃肠炎：这通常与孩子饮食不卫生、吃了生冷刺激食物、胃肠功能较弱以及细菌、病毒、真菌等病原体感染有关。孩子会有肚子疼、恶心、呕吐，还可能伴有发热、头疼、乏力等表现，进而导致头疼和肚子疼同时出现。
二、胃肠型感冒：往往和孩子不良饮食习惯引发病毒感染相关。孩子会出现恶心、呕吐、发热、头疼、肚子疼等症状，严重时可并发心悸、呼吸困难等心肌损害情况，由此引起头疼和肚子疼。
三、脑炎：多由病毒、细菌、立克次体、寄生虫等感染导致，会损伤脑组织，孩子会有头疼、恶心、呕吐等症状，同时还有发热、嗜睡等，少数孩子会有肚子疼现象，从而造成头疼与肚子疼同时发生。
四、植物神经紊乱：和家族遗传、年龄、社会等因素有关，会致使孩子植物神经功能出现障碍，表现出头疼、肚子疼，甚至烦躁、精神不集中等，进而导致头疼和肚子疼。
总之，当五岁孩子出现头疼和肚子疼时，原因较为多样复杂，需及时就医进行准确诊断和恰当治疗。