一般而言，做肠镜和胃镜时，通常肠镜会更痛苦些，但实际痛苦程度因个体差异而不同。
一、做胃镜时，胃镜要穿过咽喉部，这会刺激咽喉引发咽反射，从而导致恶心、想吐等不适，当胃镜在胃内移动时也可能刺激胃黏膜，出现恶心等症状。
二、做肠镜时，肠镜需经过乙状结肠、脾曲等部位，对这些地方的刺激会产生牵扯痛，如下腹部不适等。所以相比之下，肠镜更痛苦，不过具体情况因人而异。
三、肠镜和胃镜都需注意控制饮食，检查当日要禁食，检查后要避免体力活动。做胃镜当天既不能吃东西也不能喝水，一般做胃镜的患者通常无疼痛感，而肠镜会有稍难受的感觉。
四、但肠镜和胃镜的疼痛感受因人而异，不同人对疼痛的耐受度各不相同，做肠镜时一定要张口呼吸并调整好个人心态。
五、若出现不适症状，应立刻前往医院，在医生帮助下明确病因。
总之，肠镜和胃镜在检查过程中的感受和注意事项等各有不同，个体之间也存在差异，要根据具体情况来判断和应对。