肛门夜间瘙痒可能由多种原因引起，其中常见的有寄生虫感染，比如蛲虫感染较为多见，据统计，儿童感染蛲虫导致肛门夜间瘙痒的情况并不少见。
寄生虫感染因素
蛲虫感染： 蛲虫通常在夜间爬出肛门产卵，从而刺激肛周皮肤，引发瘙痒。蛲虫很小，呈白色线状。孩子感染后，夜间肛门周围会奇痒难忍，孩子可能会不自觉地搔抓。疥螨感染： 疥螨可寄生在人体皮肤表层，夜间活动较为活跃，会在肛门周围等部位挖掘隧道，导致局部皮肤出现炎症反应，引起瘙痒。疥螨感染往往会使皮肤出现丘疹、水疱等表现。
皮肤局部因素
肛周湿疹： 多种内外因素可引起肛周湿疹，比如局部潮湿、摩擦、过敏等。夜间时，人体代谢等情况变化，可能会加重湿疹症状，导致肛门瘙痒。肛周湿疹会让肛周皮肤出现红斑、丘疹、渗出等改变。肛周皮肤病： 像神经性皮炎，长期的搔抓、摩擦等刺激可引发肛周神经性皮炎，夜间瘙痒感可能会更明显。还有银屑病累及肛周时，也会出现瘙痒症状，皮肤会有鳞屑、红斑等表现。
全身性因素
糖尿病： 糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛周皮肤，容易引发瘙痒，尤其在夜间可能更为明显。同时，糖尿病患者皮肤抵抗力相对较低，容易合并其他感染。肝胆疾病： 比如肝胆管梗阻等肝胆疾病，会导致胆汁淤积，血液中胆盐含量升高，可引起皮肤瘙痒，肛门周围也可能受累，夜间瘙痒可能会加重。患者往往还会伴有皮肤黄疸等表现。