扁桃体经常发炎多与自身抵抗力低、病原体反复感染等因素有关。比如，儿童扁桃体炎高发，5 - 6岁是扁桃体发育的高峰期，此阶段孩子免疫力相对低，易受病菌侵袭引发发炎。
自身免疫力因素
儿童群体：儿童的免疫系统尚在发育中，5 - 12岁的儿童扁桃体处于活跃期，相比成人更容易受到病菌的侵袭，从而导致扁桃体经常发炎。例如，幼儿园集体生活的儿童，接触病原体的机会较多，扁桃体发炎的概率相对更高。免疫力低下人群：长期营养不良、过度劳累、患有慢性疾病（如糖尿病等）的人群，身体免疫力较差，无法有效抵御病原体，使得扁桃体容易反复受到病菌感染而发炎。比如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体抵抗力下降，扁桃体炎更容易反复发作。
病原体反复感染
细菌感染：最常见的是A组乙型溶血性链球菌，这种细菌容易在扁桃体隐窝内繁殖。当人体抵抗力下降时，细菌大量滋生，引发扁桃体发炎。而且，如果治疗不彻底，细菌残留，就容易导致再次发炎。病毒感染：像EB病毒、腺病毒等病毒感染也会引起扁桃体发炎。例如，腺病毒感染引起的扁桃体炎，病情可能会反复，因为病毒在体内的清除需要一定时间，且机体再次接触时又可能发病。
局部因素
扁桃体隐窝堵塞：扁桃体隐窝口容易被细菌、病毒及脱落上皮细胞、淋巴细胞等阻塞，形成小的囊肿或陷窝，为病原体的繁殖提供了“温床”，导致扁桃体经常发炎。比如，食物残渣容易滞留于扁桃体隐窝内，为病菌滋生创造条件。邻近器官炎症波及：如鼻炎、鼻窦炎等疾病，炎症蔓延至扁桃体，可引起扁桃体发炎。例如，鼻窦炎患者鼻腔分泌物倒流刺激扁桃体，长期如此会使扁桃体反复发炎。