肥厚型梗阻性心肌病的表现多样。通常患者可能出现劳力性呼吸困难，约有60%的患者会在运动或劳累后出现气短的情况；还可能有心绞痛症状，不少患者会在劳累时出现胸痛，持续时间一般在几分钟到十几分钟不等。
症状表现一：呼吸困难相关
劳力性呼吸困难： 这是比较常见的表现，多在患者进行体力活动时发生，比如快走、爬楼梯等活动后，就会出现呼吸急促的情况，大约有60%的肥厚型梗阻性心肌病患者会有此类表现。夜间阵发性呼吸困难： 部分患者还可能在夜间睡眠中突然出现呼吸困难，需要坐起才能缓解，这是因为平躺时回心血量增加，加重了心脏的负担，从而诱发呼吸困难。
症状表现二：心绞痛表现
劳力性心绞痛： 很多患者会在劳累、运动时出现胸痛症状，疼痛部位多在胸骨后或心前区，疼痛性质一般为压榨性、闷痛等，持续时间通常在3 - 15分钟左右。这是由于肥厚的心肌导致冠状动脉供血相对不足，心肌缺血缺氧引起心绞痛。非劳力性心绞痛： 少数患者可能在休息时也会发生心绞痛，机制相对复杂，可能与冠状动脉微血管功能异常等因素有关。
症状表现三：其他表现
晕厥或头晕： 部分患者可能会出现晕厥或头晕症状，这是因为肥厚型梗阻性心肌病导致左心室流出道梗阻，影响心脏的泵血功能，使得脑部供血不足，从而引发晕厥或头晕，尤其在突然站立等情况下更容易发生。乏力： 患者还可能感到全身乏力，这是因为心脏功能受到影响，心输出量减少，全身组织器官供血不足，导致患者有乏力的感觉。