根尖脓肿的排脓途径主要有以下几种：
经黏膜下或皮下排脓
通过牙槽骨的骨松质到达骨膜下形成骨膜下脓肿： 这是比较常见的过程，细菌感染根尖周组织后，炎症逐渐扩散，突破牙槽骨的骨密质到达骨膜下，此时骨膜承受的压力较大，患者会感到剧烈疼痛。例如，炎症持续发展，一般在根尖周炎发生后的数天至1 - 2周左右可能会形成骨膜下脓肿。然后穿破骨膜到达黏膜下或皮下： 骨膜下脓肿压力进一步增大，会穿破骨膜向阻力较小的黏膜下或皮下排脓，形成脓肿，此时肿胀范围相对局限，波动感较明显。比如穿破到口腔黏膜下时，可见黏膜表面隆起，呈半球形，红肿明显，有明显的波动感。
通过根尖孔经根管从冠部缺损处排脓
这种途径是最理想的排脓方式： 当根尖孔较粗大，根管通畅，冠部牙体组织有较大的缺损（如深龋洞等）时，炎症产物可以通过根尖孔，顺着根管从冠部缺损处排出。例如，患有深龋的牙齿，龋洞较深且接近牙髓，此时根尖周的炎症有可能通过根管从龋洞排出，使炎症得到缓解。不过这种情况需要牙齿本身的根管系统比较通畅，且冠部有合适的引流通道。
经上颌窦或下颌窦排脓
这种情况相对较少见： 上颌后牙的根尖周脓肿有可能穿破上颌窦壁，进入上颌窦；下颌后牙的根尖周脓肿也有可能波及下颌窦，从而通过上颌窦或下颌窦排脓。但这种情况往往会伴有相应鼻窦的炎症症状，比如上颌窦受累时可能会有鼻塞、流涕等症状，而且需要注意的是，这种排脓途径可能会引发鼻窦的感染等并发症，需要及时进行处理。