早晨总是咳嗽可能由多种原因引起。比如，过敏性鼻炎就可能导致早晨咳嗽，患者鼻腔分泌物在夜间倒流至咽喉，早晨就会引发咳嗽，这类人群可能在接触花粉、尘螨等过敏原后症状加重。
气道炎症因素
慢性支气管炎： 多见于长期吸烟人群，气管、支气管黏膜及周围组织的慢性非特异性炎症，早晨时气管内分泌物增多，刺激气道引发咳嗽，病程较长的患者可能会有多年咳嗽病史，且每年咳嗽持续3个月以上，连续2年或更长时间。肺炎恢复期： 如果之前患过肺炎，在恢复期早晨也可能仍有咳嗽，一般肺炎康复需要1 - 2周左右，但部分患者可能早晨咳嗽持续时间稍长，是因为肺部炎症虽基本吸收，但气道黏膜修复还需要时间。
环境因素影响
室内空气问题： 若室内空气干燥，夜间睡眠时气道黏膜水分流失，早晨就容易刺激咳嗽。一般室内相对湿度保持在40% - 60%较为适宜，干燥环境下可使用加湿器来调节湿度。还有室内存在刺激性气味，比如新装修的房子有甲醛等异味，也会在早晨刺激呼吸道引发咳嗽。温度变化： 早晨气温相对较低，人体呼吸道受到冷空气刺激，容易引起咳嗽。尤其是体质较弱的人群，如老人和儿童，对温度变化更敏感，早晨外出时如果没有做好保暖，咳嗽可能会加重。
胃食管反流因素
胃食管反流： 夜间平卧时，胃酸等胃内容物容易反流至食管，刺激咽喉部，早晨就会出现咳嗽症状。这类患者可能还伴有烧心、反酸等症状，尤其是进食过多油腻、辛辣食物后更容易诱发。一般建议患者睡觉时可将床头抬高15 - 20厘米，减少夜间反流情况。