新生儿败血症主要通过抗感染治疗等方式来治疗。一般来说，需要及时选用合适的抗生素进行治疗，通常要持续用药数周。
抗感染治疗的药物选择
抗生素的选择： 根据病原菌选用敏感的抗生素是关键。如果是革兰阳性球菌感染，可能会选用青霉素类等抗生素；若是革兰阴性杆菌感染，可能会用到第三代头孢菌素等。比如氨苄西林对部分革兰阳性球菌有一定作用，而头孢他啶对一些革兰阴性杆菌效果较好。抗生素的应用原则： 要早期、足量、静脉给药。早期用药能及时控制感染扩散，足量用药才能保证血液中的药物浓度达到有效杀菌水平，静脉给药能使药物更快地到达病灶部位发挥作用。
支持对症治疗
营养支持： 新生儿败血症时身体消耗大，需要保证充足的营养供应。可以通过静脉输注营养液来提供热量、蛋白质、维生素等营养物质，维持新生儿的能量代谢和生长发育需求。一般每天要保证足够的热量摄入，比如每千克体重需要一定量的热卡供应。维持内环境稳定： 要密切监测新生儿的电解质、酸碱平衡等情况。如果出现电解质紊乱，如低钠、低钾等，需要及时进行纠正；对于酸碱平衡失调，也要根据具体情况进行相应的调整，以保证新生儿内环境处于稳定状态，利于身体各器官功能的恢复。
处理并发症
肺炎的处理： 如果新生儿败血症合并肺炎，要保持呼吸道通畅。可以通过翻身、拍背等方式促进痰液排出，必要时进行吸氧等处理。如果肺炎较为严重，可能需要使用支气管扩张剂等药物来改善通气功能。脑膜炎的处理： 若并发脑膜炎，需要密切观察新生儿的神经系统症状，如意识、肌张力等情况。可能需要进行腰椎穿刺等检查来明确病情，同时给予相应的药物治疗，控制颅内感染，降低颅内压等，防止出现严重的神经系统后遗症。