肝癌可以通过多种检查方式来发现，比如血清甲胎蛋白（AFP）检测联合超声检查是常用的筛查手段。一般来说，血清AFP检测结合腹部超声检查能较好地筛查肝癌，其中血清AFP检测的阳性率在70%左右。
血清学检查
甲胎蛋白（AFP）检测： AFP是一种糖蛋白，正常情况下，人体血清中的AFP含量很低。但肝癌细胞能合成AFP，所以检测血清AFP对肝癌的诊断有一定价值。大约70%的肝癌患者血清AFP会升高，不过也有部分肝癌患者AFP不升高，需要结合其他检查综合判断。其他血清学指标： 除了AFP，还有异常凝血酶原（DCP）、高尔基体蛋白73（GP73）等指标也可能辅助诊断肝癌。比如DCP在肝癌患者中的阳性率也较高，可作为肝癌诊断的补充指标。
影像学检查
超声检查： 超声检查是肝癌筛查的常用方法，它价格相对便宜，操作简便，能发现肝脏内直径1厘米左右的占位性病变。超声可以观察肝脏的形态、大小、有无肿块以及肿块的位置、大小、血流情况等。不过，超声检查受操作者经验和患者体内气体等因素影响，对于一些靠近膈肌或较小的病灶可能会有漏诊情况。CT检查： 增强CT检查对肝癌的诊断价值较高。通过注射造影剂，能更清晰地显示肝脏病灶的血供情况，有助于区分肝癌和其他肝脏占位性病变。CT可以发现直径小于1厘米的肝癌病灶，对于肝癌的分期等也有重要意义。一般来说，增强CT能准确判断肝癌病灶的大小、数目、位置以及与血管的关系等。MRI检查： 磁共振成像（MRI）对肝癌的诊断敏感性较高，尤其是对一些小肝癌的诊断。MRI在显示病灶的细节方面比CT更有优势，对于鉴别诊断肝血管瘤等疾病有独特价值。而且MRI不需要使用含碘造影剂，对肾功能不全的患者更安全。
肝穿刺活检
穿刺活检方法： 肝穿刺活检是一种有创的检查方法，在超声或CT引导下，用穿刺针获取肝脏组织进行病理检查。通过病理检查可以明确肝脏病变的性质，是诊断肝癌的金标准。但肝穿刺活检有一定的出血等风险，需要严格掌握适应证。比如当其他检查高度怀疑肝癌，但又不能明确诊断时，可考虑进行肝穿刺活检。不过对于一些靠近大血管等部位的病灶，穿刺风险较高，需要谨慎操作。