结肠炎的治疗药物需根据类型选择，比如溃疡性结肠炎常用氨基水杨酸制剂，像柳氮磺吡啶，一般需要规律用药数周甚至数月；而对于一些炎症较重的情况，可能会用到糖皮质激素，如泼尼松等。
氨基水杨酸制剂类药物
5-氨基水杨酸制剂：这类药物是轻、中度溃疡性结肠炎的常用药物。它可以局部作用于结肠黏膜，抑制炎症反应。例如柳氮磺吡啶，适用于轻、中度患者或重度经糖皮质激素治疗缓解者。不过部分人服用后可能会出现恶心、呕吐等胃肠道不适。美沙拉嗪：也是常见的氨基水杨酸制剂，有口服剂型也有灌肠剂型。口服美沙拉嗪用于治疗轻、中度溃疡性结肠炎；美沙拉嗪灌肠剂则主要针对病变局限在直肠的患者，能直接作用于直肠炎症部位，减轻症状，使用时要注意按照正确方法给药。
糖皮质激素药物
泼尼松：对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中度、重度溃疡性结肠炎患者，可考虑使用糖皮质激素。泼尼松能快速减轻炎症反应，但长期使用可能会有较多副作用，比如引起骨质疏松、血糖升高、免疫力下降等，所以需要在医生严密监测下使用，根据病情逐渐调整剂量。氢化可的松：重症结肠炎患者有时会用到氢化可的松静脉滴注，它抗炎作用较强，能迅速缓解严重的炎症症状，但同样要注意其可能带来的如感染风险增加、电解质紊乱等不良反应。
免疫抑制剂类药物
硫唑嘌呤：适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或依赖的慢性活动性结肠炎患者。它通过抑制免疫反应发挥作用，但起效相对较慢，一般需要数月才能看到明显效果。使用期间要定期监测血常规、肝功能等指标，因为可能会引起白细胞减少、肝功能损害等问题。巯嘌呤：与硫唑嘌呤作用机制类似，也可用于结肠炎的治疗，尤其适用于对其他药物疗效不佳的患者。同样需要关注血液系统和肝功能的变化情况。
生物制剂类药物
英夫利昔单抗：对于重度且对传统治疗药物无效的溃疡性结肠炎患者，生物制剂可能是一种选择。英夫利昔单抗通过特异性结合肿瘤坏死因子 - α发挥作用，能有效减轻炎症，但这类药物价格相对较高，而且使用过程中要警惕感染等不良反应的发生，使用前需要进行严格的筛查。