肛门瘙痒的原因有多种。一般来说，约40%的肛门瘙痒与皮肤疾病相关，比如接触性皮炎，常因接触化纤内裤、卫生巾等致敏物质引发，会出现肛门周围皮肤红斑、瘙痒等症状；而肛周湿疹也是常见原因，它可能由过敏、潮湿等多种因素导致，表现为肛门皮肤潮湿、丘疹、瘙痒难耐。
皮肤疾病因素
接触性皮炎： 接触如某些劣质卫生纸、新换的内裤材质等致敏物质后，肛门周围皮肤会发生过敏反应，出现瘙痒症状，严重时还可能有红肿、小水疱等表现。肛周湿疹： 长期处于潮湿环境，比如久坐、出汗多等情况，容易引发肛周湿疹，使得肛门皮肤出现瘙痒、渗出、结痂等改变，而且瘙痒感往往在夜间加重。
肛肠疾病因素
痔疮： 当痔疮发作时，尤其是内痔脱出嵌顿，会刺激肛门周围的分泌物增多，这些分泌物会刺激皮肤，导致肛门瘙痒，同时还可能伴有便血、肛门肿物脱出等症状。肛瘘： 肛瘘外口会持续有脓性、血性分泌物渗出，这些分泌物刺激肛门周围皮肤，就会引起瘙痒，而且肛瘘患者还会有反复的肛周肿痛等表现。
寄生虫感染因素
蛲虫感染： 尤其是儿童容易感染蛲虫，夜间蛲虫会爬出肛门产卵，刺激肛门周围皮肤，导致剧烈瘙痒，可在夜间明显感觉到肛门部位有瘙痒感，甚至能看到蠕动的蛲虫。阴虱： 阴虱寄生在肛门周围及会阴部的毛发上，叮咬皮肤会引起瘙痒，同时能在毛发上发现阴虱或虫卵。
全身性疾病因素
糖尿病： 糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛门周围皮肤，容易引发瘙痒，同时患者还可能有多饮、多食、多尿等糖尿病典型症状。肝胆疾病： 像肝胆管梗阻等肝胆疾病，会导致胆汁淤积，血液中胆盐含量升高，沉积在皮肤会引起瘙痒，肛门周围皮肤也可能受到影响出现瘙痒症状。