甲状腺肿大的原因有多种。一般来说，碘缺乏是常见原因之一，在一些地区，由于饮食中碘摄入不足，人群中甲状腺肿大的发生率可能达到一定比例，比如在一些严重缺碘地区，甲状腺肿大患病率较高。
碘缺乏相关
碘摄入不足： 人体需要从饮食中获取足够的碘来维持甲状腺正常功能。如果长期饮食中碘含量低，像一些山区或远离海洋且饮食结构单一的地区，人们从食物和水中摄取的碘不足，就会影响甲状腺激素合成，进而刺激甲状腺代偿性肿大。碘过量： 虽然碘缺乏会导致甲状腺肿大，但碘过量也可能引发。比如长期大量食用含碘丰富的食物，像一些含碘药剂服用过量等情况，也会干扰甲状腺正常代谢，引起甲状腺肿大。
自身免疫因素
自身免疫性甲状腺炎： 例如桥本甲状腺炎，这是一种自身免疫性疾病。自身免疫系统错误地攻击甲状腺组织，导致甲状腺炎症反应，长期炎症刺激会使甲状腺肿大。这种情况在女性中相对更常见，而且可能有家族遗传倾向。Graves病： 也是自身免疫性疾病，患者体内会产生促甲状腺激素受体抗体，刺激甲状腺过度增生和甲状腺激素分泌过多，从而出现甲状腺肿大，同时往往伴有甲状腺功能亢进的表现，如心慌、多汗、消瘦等。
药物及其他因素
某些药物影响： 一些药物可能会影响甲状腺功能导致肿大。比如胺碘酮，长期服用胺碘酮的患者，因为药物中含碘，可能会干扰甲状腺正常生理过程，引发甲状腺肿大。还有锂剂等药物，也可能对甲状腺产生不良影响导致肿大。先天性甲状腺激素合成障碍： 有些人生来就存在甲状腺激素合成相关的酶缺陷，导致甲状腺激素合成过程出现问题，为了合成足够的甲状腺激素，甲状腺会代偿性肿大，这种情况从出生后就可能逐渐表现出来。