甲状腺肿大的原因有多种。比如碘缺乏是常见原因之一，在一些碘摄入不足的地区，人群甲状腺肿大患病率可能较高。
碘摄入异常导致
碘缺乏：当人体长期处于碘摄入不足的状态时，甲状腺会代偿性增生肿大。比如一些远离海洋且土壤中碘含量低的地区，居民日常饮食中碘摄入不足，就容易出现甲状腺肿大。碘过量：短期内大量摄入碘也可能引起甲状腺肿大，比如误服含碘量高的药物等情况。
疾病因素引发
甲状腺炎：像慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本病），是一种自身免疫性疾病，免疫系统错误攻击甲状腺组织，会导致甲状腺肿大。亚急性甲状腺炎也可能引起甲状腺肿大，通常与病毒感染有关，发病前可能有上呼吸道感染病史。甲状腺肿瘤：甲状腺良性肿瘤或者恶性肿瘤都可能导致甲状腺肿大，良性肿瘤如甲状腺腺瘤，恶性肿瘤如甲状腺癌等，肿瘤的生长会使甲状腺局部或整体肿大。
先天性因素影响
先天性甲状腺激素合成障碍：由于遗传等因素导致甲状腺激素合成过程中某些酶缺乏，使得甲状腺激素合成不足，进而刺激甲状腺增生肿大。比如先天性碘化物运输酶缺陷等情况，会影响甲状腺对碘的摄取和利用，引发甲状腺肿大。