男性乙肝病毒携带者生孩子不会遗传。
一、乙肝病毒的性质：乙肝病毒是传染性疾病而非遗传性疾病。
二、男方为乙肝病毒携带者的处理：男方是乙肝病毒携带者时，在发现乙肝后需积极进行随访观察。当有抗病毒指征时，应积极开展抗病毒治疗，尽可能抑制乙肝病毒复制，以防止出现肝脏炎症等病变，如此可显著降低乙肝的传染性。这种情况下，同房性接触后传播乙肝的几率会变得极小，同时乙肝传染给孩子的可能性也会大大降低。
三、阻断措施：不管是男方还是女方有乙肝，都一定要重视阻断。小孩出生后24小时内要及时积极注射乙肝免疫球蛋白以及乙肝疫苗，通过这样的方式能够有效阻断乙肝的传播。
总之，男性乙肝病毒携带者不会遗传给孩子，但要注意相关处理和阻断措施，以降低传染风险。