新生儿甲状腺功能低下是可以治疗的。
一、先天性甲状腺功能减退症的原因：
1.由儿童先天性甲状腺缺陷引起的称为散发性甲减。
2.由孕期饮食缺碘引起的称为地方性甲减。
二、治疗方面：
1.一旦发现甲减，需立即开始治疗，先天性甲低需终身服用甲状腺素，若早期治疗，智力可正常，如在10个月以后才开始治疗，只能达到正常智商的80%；2岁以上开始治疗时，会出现不可逆的智力低下。
2.有些类型的甲状腺功能低下采用甲状腺素替代疗法后，若是暂时性甲减，常规治疗持续2-3年，停药1个月后复检甲状腺功能、甲状腺B超或甲状腺同位素扫描，若结果显示为暂时性甲减可停药并定期随访，若是永久性甲减则需要终身治疗。
总之，对于新生儿甲状腺功能低下，要及时诊断并根据具体情况进行相应治疗，以尽量减少对患儿智力等方面的不良影响。同时要密切关注治疗效果和病情变化，以便及时调整治疗方案。