发烧时全身酸痛主要是因为身体被病原体入侵后，免疫系统被激活，会产生如前列腺素等致痛物质，同时，发烧引起的肌肉代谢加快，无氧呼吸产生乳酸堆积，这些都会导致全身酸痛。
感染性因素致全身酸痛
当病毒或细菌等病原体感染人体引发发烧时，免疫系统释放的炎性介质会作用于神经末梢，刺激产生疼痛信号，使得全身肌肉等组织感觉酸痛，比如流感病毒感染引发的发烧常伴随明显全身酸痛。
非感染性因素致全身酸痛
一些非感染性疾病也可能引起发烧及全身酸痛，像自身免疫性疾病，机体免疫系统错误攻击自身组织，在引发发烧的同时会导致关节、肌肉等部位酸痛，例如类风湿关节炎活动期可出现发烧伴全身酸痛。
儿童发烧全身酸痛特点
儿童发烧时全身酸痛可能更明显，因为儿童神经系统发育不完善，对疼痛更敏感，且儿童新陈代谢快，发烧时肌肉代谢变化引发酸痛的反应相对成人更突出，家长需密切关注儿童发烧伴随的全身酸痛情况，及时采取合适措施。
老人发烧全身酸痛注意事项
老年人发烧伴全身酸痛时要格外留意，老年人身体机能衰退，对疼痛的耐受和应对能力下降，且可能合并多种基础疾病，需及时监测体温和身体状况，必要时就医，避免因全身酸痛影响健康状况的判断和处理。