阴茎和阴囊水肿的治疗需根据不同病因来定。如果是外伤导致的轻度阴茎和阴囊水肿，在受伤后的24小时内可先进行冷敷，减少肿胀，24小时后改为热敷，促进血液循环，帮助消肿。
外伤引起的水肿治疗
局部冷敷：受伤后的急性期，也就是24小时内，用冰袋或冷毛巾敷在水肿部位，每次冷敷15 - 20分钟，每隔1 - 2小时可冷敷一次。这样做能收缩血管，减少局部出血和肿胀。局部热敷：受伤24小时后，可改用热毛巾或热水袋热敷，温度控制在40 - 50℃，每次热敷15 - 20分钟，每天可热敷3 - 4次，能促进血液循环，加速水肿消退。
感染导致的水肿治疗
抗感染药物：如果是细菌感染引起的阴茎和阴囊水肿，需要使用抗生素治疗。常用的抗生素有头孢类等，这类药物能抑制细菌生长繁殖，从而减轻炎症和水肿。但要在医生指导下使用，不可自行用药。局部清洁消毒：要保持阴茎和阴囊部位的清洁卫生，可用碘伏等消毒剂进行局部消毒，每天消毒2 - 3次，防止感染进一步加重。
过敏引起的水肿治疗
避免接触过敏原：首先要找出引起过敏的物质并避免再次接触。比如对某种内裤材质过敏，就应更换其他不过敏的材质内裤。抗过敏药物：可使用抗组胺药物，如氯雷他定等，这类药物能对抗过敏反应，减轻水肿等过敏症状。但用药需遵循医生建议。