耳膜穿孔的治疗方式需根据穿孔情况等决定，一般小的耳膜穿孔有自愈可能，约4-6周可自行愈合。如果穿孔较大长时间未愈合则需手术修复。
小穿孔的观察等待
小穿孔特点： 直径小于0.5厘米的耳膜穿孔，多数可自行愈合。一般要保持外耳道清洁干燥，避免进水，洗头、洗澡时可用棉球堵住外耳道防止污水进入。通常观察2-3个月，期间要避免用力擤鼻，防止鼻腔分泌物经咽鼓管进入中耳引起感染。感染预防： 若有上呼吸道感染情况，要及时治疗，因为上呼吸道感染可能加重中耳炎症，影响耳膜穿孔愈合。比如感冒时出现鼻塞，要谨慎擤鼻，可采用正确方法轻轻擤一侧鼻孔。
手术治疗情况
较大穿孔的手术： 当耳膜穿孔直径大于0.5厘米，且观察3-6个月仍未愈合时，需考虑手术修复。手术方式多为鼓膜修补术，通过移植自身的筋膜等组织来修复穿孔的耳膜。一般手术时间较短，术后要注意耳部护理，按照医生要求定期换药，避免剧烈运动，防止头部过度晃动影响耳膜修复。手术风险： 任何手术都有一定风险，鼓膜修补术可能出现感染、修补失败等情况，但现在技术较成熟，失败概率相对较低，一般在5% - 10%左右。
合并中耳炎症的处理
炎症控制： 如果耳膜穿孔同时伴有中耳炎症，如分泌性中耳炎或化脓性中耳炎，要先控制炎症。对于分泌性中耳炎，可能需要使用鼻用糖皮质激素喷鼻，如糠酸莫米松鼻喷雾剂等，减轻咽鼓管黏膜水肿，促进中耳积液排出。对于化脓性中耳炎，要根据细菌培养和药敏试验结果选用合适的抗生素，如头孢类抗生素等，一般需要规范使用抗生素1-2周，确保中耳炎症得到有效控制，否则炎症持续存在会影响耳膜穿孔愈合甚至导致病情加重。炎症对愈合的影响： 中耳炎症未控制时，即使进行耳膜穿孔修复手术，也容易出现手术失败的情况，因为炎症环境不利于耳膜组织的修复和愈合。所以必须先把中耳炎症控制住，再考虑后续的治疗方案。