3岁宝宝突然眨眼睛频繁的治疗方法包括药物治疗、手术治疗、心理辅助等，具体取决于病因，主要病因有过敏性结膜炎、睑内翻倒睫等。
一、过敏性结膜炎：当眼结膜受到如尘螨、灰尘、花粉、动物皮屑等过敏原刺激时，会引发超敏反应。患儿会表现出眼痒、频繁眨眼、分泌物增多、白眼球发红等过敏性结膜炎症状。可选择抗组胺药物进行治疗，常用的有盐酸左卡巴斯汀滴眼液，同时可配合口服苯海拉明、氯雷他定等药物，注意药物需在医生指导下使用。
二、睑内翻倒睫：如果患儿经常眨眼，可能是眼睛里存在睑内翻倒睫。异常生长的倒睫会持续刺激角膜，甚至导致角膜有异物感或发炎，从而引起儿童频繁眨眼。可以进行睑内翻矫正术和倒睫拔除术，同时使用促进角膜生长的药物如贝复舒滴眼液来促进角膜损伤修复，以缓解眨眼症状。
三、其他：宝宝长时间看电子产品导致视疲劳或干眼症等，也会引起眼睛干涩而频繁眨眼。日常要注意用眼卫生，根据情况可选用人工泪液如玻璃酸钠滴眼液等来缓解眼干涩和眨眼。此外，抽动症也可能出现眨眼症状，可前往儿科就诊治疗，如进行心理辅导等。
总之，3岁宝宝突然频繁眨眼睛应及时就医，明确原因后遵医嘱进行相应治疗。