牙齿上药后疼痛需根据不同情况处理。若为正常药物反应短时间疼痛，可先观察。若疼痛较明显，首先要排查是否上药不当导致刺激。
一、药物正常反应致痛
若因药物对牙髓等正常组织有轻微刺激引起短痛，一般数小时内可缓解，期间避免用患侧咀嚼，保持口腔清洁。
二、上药不当致痛
若因上药时药物超出病变部位刺激周围组织致痛，需及时复诊，由医生调整上药情况。
三、疾病本身发展致痛
某些牙齿疾病未控制好，即使上药后仍可能疼痛，如急性牙髓炎上药后，可能仍有疼痛，需进一步采取开髓引流等措施缓解，儿童患者更要及时处理，避免疼痛加重影响进食和生长发育等。
四、个体差异致痛
不同患者对药物及治疗反应不同，有的可能上药后疼痛稍明显，要根据具体情况，如成人与儿童体质不同，儿童更需轻柔处理，观察疼痛变化，必要时采取相应止痛措施。