做胎儿亲子鉴定的准确性较高，目前常用的胎儿亲子鉴定方法有羊水穿刺亲子鉴定和无创胎儿亲子鉴定等，其中无创胎儿亲子鉴定的准确率能达到99.9%以上。
羊水穿刺亲子鉴定
样本采集方式： 需要在怀孕16~22周时，通过穿刺抽取羊水来获取胎儿细胞。检测时间： 一般在抽取羊水后的1~2周内可以得到鉴定结果。准确性： 羊水穿刺亲子鉴定的准确性较高，能达到99.9999%，但它属于有创检查，存在一定的流产风险，流产概率约为0.5%。
无创胎儿亲子鉴定
样本采集方式： 只需采集孕妇外周血即可，因为孕妇外周血中含有胎儿游离DNA。检测时间： 通常在怀孕7周以上就可以进行检测，一般7~10个工作日能出结果。准确性： 无创胎儿亲子鉴定的准确率也能达到99.9%以上，它是无创的，相对安全，对孕妇和胎儿没有创伤性影响。
绒毛穿刺亲子鉴定
样本采集方式： 在怀孕11~14周时，通过穿刺获取胎儿绒毛组织。检测时间： 绒毛穿刺后的1~2周左右可以出结果。准确性： 其准确性同样较高，但也是有创检查，流产风险相对羊水穿刺稍高，约为0.5%~1%。不过它能更早地进行胎儿亲子鉴定。