子宫内膜增生紊乱主要是由于体内雌激素长期刺激，而缺乏孕激素对抗引起的。例如，一些无排卵性的月经周期，就可能导致这种情况发生，据统计，约有相当比例的子宫内膜增生紊乱与内分泌失调相关。
内分泌失调因素
长期无排卵： 女性如果长期不排卵，卵巢就只会持续分泌雌激素，而没有孕激素来转化子宫内膜。比如多囊卵巢综合征患者，常常存在排卵障碍，体内雌激素水平偏高，子宫内膜长期受雌激素刺激，就容易出现增生紊乱。雌激素使用不当： 长期单独使用雌激素药物，而没有配合孕激素拮抗，也会引发子宫内膜增生紊乱。像一些绝经后女性为了缓解更年期症状自行长期单用雌激素，就增加了患病风险。
疾病相关因素
肥胖因素： 肥胖女性体内脂肪较多，脂肪会将雄激素转化为雌激素，使得体内雌激素水平持续处于较高状态。有研究发现，肥胖女性发生子宫内膜增生紊乱的几率比正常体重女性要高不少。内分泌疾病影响： 一些患有甲状腺功能减退等内分泌疾病的女性，也可能出现子宫内膜增生紊乱情况。因为甲状腺功能减退会影响激素的正常代谢，进而干扰子宫内膜的正常增生状态。
其他相关因素
年龄因素： 围绝经期和绝经后女性是子宫内膜增生紊乱的高发人群。围绝经期女性卵巢功能逐渐衰退，内分泌处于不稳定状态；绝经后女性雌激素分泌减少但仍有一定水平，且缺乏排卵，子宫内膜容易出现异常增生。外源性激素摄入： 长期服用含有雌激素的保健品等，也可能导致体内雌激素水平异常，引发子宫内膜增生紊乱。比如一些女性长期服用含雌激素的美容保健品，就可能增加患病风险。