药流第3天在医院的主要流程为服用米索前列醇促使胚胎排出，必要时需进行清宫处理。
药物流产所用药物包含米非司酮和米索前列醇。一、女性在前两天服用米非司酮后，会使胚胎活性降低，子宫内膜变得较为疏松。二、第3天到医院服用米索前列醇会引发子宫收缩，进而助力胚胎排出体外。在整个服药过程中，随时可能因胚胎剥离而导致出血现象。(1)如果出血量大过月经量，那么随时都可能需要给予清宫操作。(2)倘若胚胎排出后阴道出血较少，也需要复查彩超，要是彩超显示有较多的宫腔内残留，同样需要在医生指导下进行清宫手术治疗。
总之，建议女性在进行药流期间，一旦出现特殊不适，务必尽早前往医院。