器质性心脏病是由心脏本身的器质性病变引起的心脏功能异常，其成因较多。比如先天性因素，部分婴儿在胚胎发育过程中，约5% - 8%会出现心脏结构发育异常，像房间隔缺损、室间隔缺损等先天性心脏病，就是胚胎时期心脏发育障碍导致的器质性心脏病。
一、遗传因素相关
基因突变影响：某些特定的基因突变会增加患器质性心脏病的风险。例如，长QT综合征相关基因发生突变时，就可能引发心脏电生理异常，导致器质性心脏病的发生。研究发现，约20% - 30%的肥厚型心肌病与基因遗传有关，是由于编码心肌肌小节蛋白的基因发生突变，使得心肌肥厚，影响心脏正常结构和功能。
二、感染因素导致
病毒感染：病毒感染是引发器质性心脏病的常见原因之一。比如柯萨奇B病毒感染，在病毒感染人体后，可能会直接侵袭心肌，引起病毒性心肌炎，若急性期未得到有效控制，迁延不愈就可能发展为扩张型心肌病等器质性心脏病。据统计，约有10%左右的病毒性心肌炎患者可能会进展为慢性心肌病。另外，风疹病毒感染也可能累及心脏，导致先天性风疹综合征，引起心脏瓣膜病变等器质性心脏病表现。
三、心血管系统老化因素
年龄相关变化：随着年龄增长，心脏也会出现器质性改变。老年人的心脏瓣膜会发生退行性变，像主动脉瓣钙化就是常见的情况，这会影响心脏瓣膜的正常开闭功能，导致心脏负担加重，逐渐发展为器质性心脏病。据临床统计，65岁以上人群中，约有2% - 7%会出现明显的主动脉瓣钙化相关的器质性心脏问题。同时，冠状动脉粥样硬化也随年龄逐渐加重，冠状动脉粥样硬化性心脏病是老年人常见的器质性心脏病，随着年龄增加，动脉壁弹性下降，脂质易沉积，导致血管狭窄甚至堵塞，影响心肌供血，引发心脏器质性病变。