如果女性自然流产没有流干净，可能会产生以下三种后果：
一、损伤子宫、感染炎症：女性自然流产未流净时需进行清宫处理，而清宫操作会给子宫内膜带来一定损伤，使其逐渐变薄，对日后正常受孕产生影响。并且若术后护理不佳，就极易引发炎症，患上妇科疾病。
1.损伤子宫：清宫过程会对子宫内膜造成损害，多次清宫可能导致子宫内膜变得非常薄，这会大大降低受孕的机会，即使受孕也可能出现诸如习惯性流产等问题。
2.感染炎症：术后护理不当，细菌等病原体容易侵入，引发阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎等各种妇科炎症，会出现白带异常、下腹疼痛等症状。
二、细菌感染：如果女性选择的医院不正规，医生做手术时器械未完全消毒，或手术时未注重无菌环境的创建，那么女性在这场手术中很可能出现子宫内感染。若细菌感染未及时发现和清除，甚至会蔓延至输卵管和骨盆腔，从而容易导致女性不孕。
1.手术环境问题：不正规医院可能在无菌操作方面存在漏洞，如手术器械消毒不彻底、手术区域未严格消毒等，为细菌感染创造了条件。
2.感染的危害：细菌感染后若扩散到输卵管，可能引起输卵管炎症、堵塞等，影响卵子的输送；若扩散到骨盆腔，可引发盆腔炎等疾病，进一步影响生殖系统的正常功能，导致不孕。
三、宫颈或内膜粘黏：女性做清宫手术时，如果医生操作技术欠佳，容易出现子宫穿孔情况。若子宫内有异物滞留，就容易出现大出血、月经淋漓不尽甚至不孕等后果。
1.操作不当的后果：技术不好的医生进行清宫手术可能导致子宫穿孔，这不仅会引起严重的疼痛和出血，还可能引发一系列并发症。
2.异物滞留的影响：子宫内有异物会影响子宫的正常收缩和修复，导致出血异常，长期如此可能影响生育功能。
总之，女性自然流产后一定要密切关注是否流干净，若有异常要及时就医处理，选择正规医院和专业医生进行诊治，以避免上述不良后果的发生。