屁眼里面疼可能由多种原因引起，比如常见的痔疮，Ⅲ度以上的内痔脱出嵌顿，可导致明显的肛门内疼痛，还可能伴有便血等症状。一般来说，引起屁眼里面疼的原因主要有以下几类：
痔疮导致的屁眼里面疼
内痔脱出嵌顿： 当内痔发展到Ⅲ度及以上时，排便时容易脱出肛门外，若不能及时回纳，就会发生嵌顿，引起肛门内剧烈疼痛，还可能伴有水肿。血栓性外痔： 肛门周围皮下静脉破裂出血，形成血栓，会导致肛门内突发剧烈疼痛，能摸到硬结样肿物。
肛周感染引发的屁眼里面疼
肛窦炎： 肛窦受到细菌感染，会出现肛门内坠胀、疼痛，排便时疼痛加重，还可能有少量黏液流出。一般肛窦炎若不及时治疗，可能会发展为肛周脓肿。肛周脓肿： 肛门周围软组织发生化脓性感染，初期表现为肛门内持续性疼痛，逐渐加重，局部还会红肿、发热，严重时可伴有全身发热等症状。
肠道炎症造成的屁眼里面疼
溃疡性结肠炎： 这是一种慢性非特异性肠道炎症性疾病，除了有腹泻、黏液脓血便等症状外，也可能出现肛门内疼痛，疼痛程度不一。病程较长的患者还可能出现消瘦、贫血等全身症状。克罗恩病： 可累及胃肠道各部位，当病变累及肛门直肠时，会引起肛门内疼痛、溃疡、瘘管形成等表现，病情容易反复发作。
其他原因导致的屁眼里面疼
肛裂： 肛管皮肤全层裂开形成的小溃疡，排便时会出现肛门内刀割样或烧灼样疼痛，便后有短暂缓解，随后又会出现长时间的疼痛，还常伴有便血。肠道寄生虫感染： 比如蛔虫、蛲虫等感染肠道，有时也可能引起肛门内的不适或疼痛，尤其是蛲虫，常在夜间爬出肛门产卵，导致肛门周围及里面瘙痒、疼痛。