孕五十天有褐色分泌物的原因包括受精卵着床、先兆流产、异位妊娠等，需根据具体情况选择处理方式。具体如下：
一、受精卵着床：怀孕初期，受精卵着床后会在宫腔逐渐增大，这期间可能会有出血现象，从而导致孕五十天出现褐色分泌物，此为正常情况，通常无需特殊治疗。
1.原理阐述：受精卵在着床过程中会对子宫内膜造成一定刺激，引起少量出血。
2.症状特点：一般出血量较少，表现为褐色分泌物，可能持续数天。
二、先兆流产：孕五十天有褐色分泌物可能是先兆流产引起，易出现阴道流血等情况。孕妇可在医生指导下使用炔诺孕酮片、地屈孕酮片等药物治疗，必要时需及时终止妊娠。
1.原因分析：可能与胚胎染色体异常、母体疾病、内分泌异常等多种因素有关。
2.治疗措施：
(1)药物治疗：遵医嘱使用孕激素等药物进行保胎。
(2)终止妊娠：若流产难以避免或胚胎发育异常，可能需要终止妊娠。
三、异位妊娠：即受精卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠过程，常表现为孕五十天有褐色分泌物、阴道流血、停经等，孕妇需进行血HCG检查、医学超声检查等，明确后采用输卵管切开术、腹腔镜手术等手术治疗。
1.表现说明：除了褐色分泌物和阴道流血，还可能伴有腹痛等症状。
2.诊断方法：通过相关检查来确定妊娠部位。
3.手术方式：根据具体情况选择合适的手术方法。
总之，当孕五十天出现褐色分泌物时，应及时就医，明确原因后采取相应的处理措施。如果是正常的受精卵着床出血，无需过度担心；若是先兆流产或异位妊娠等异常情况，则需根据具体情况进行治疗或处理。