扁平疣的根治方法主要包括以下几种：
1.物理治疗：
冷冻治疗：利用低温作用于疣体，使组织坏死脱落，适用于扁平疣数目较少者。
电灼疗法：通过电流产生的热效应破坏疣体，操作简单，但可能会留下疤痕。
激光治疗：利用激光的高温作用碳化疣体，具有出血少、恢复快的优点。
2.药物治疗：
外用药物：包括维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等，可促进疣体脱落。
口服药物：如抗病毒药物（如利巴韦林）、免疫调节剂（如转移因子）等，可调节免疫功能，帮助清除病毒。
3.手术治疗：
适应证：对于疣体较大或药物治疗无效者，可考虑手术切除。
注意事项：手术切除后可能会留下疤痕，且有复发的风险。
扁平疣具有传染性，患者应注意个人卫生，避免搔抓疣体，以免自身接种或传染给他人。同时，患者应在医生的指导下选择合适的治疗方法，并坚持治疗，以提高治愈率。对于扁平疣的治疗，应根据患者的具体情况制定个性化的方案，治疗过程中如有任何不适，应及时就医。