囊肿性痤疮是一种较为严重的痤疮类型，其发生与多种因素相关。一般来说，毛囊皮脂腺导管角化异常是导致囊肿性痤疮的重要原因之一，约有80%左右的痤疮患者存在不同程度的毛囊皮脂腺导管角化过度情况。
皮脂腺分泌旺盛：
激素水平影响： 青春期时，体内雄激素水平升高，会刺激皮脂腺增生和分泌，使得皮脂分泌量增加。例如，雄激素可使皮脂腺活性增强，皮脂分泌比平时增加30%以上。雄性激素主要由睾丸分泌，女性则主要由肾上腺皮质和卵巢分泌少量雄激素。遗传因素： 如果家族中有痤疮患者，那么个体患囊肿性痤疮的风险可能会增加。研究发现，遗传因素可以影响皮脂腺的大小和活性，使得某些人更容易出现皮脂腺分泌旺盛的情况，进而引发囊肿性痤疮。
毛囊微生物感染：
痤疮丙酸杆菌感染： 痤疮丙酸杆菌是皮肤表面的正常菌群之一，但在毛囊皮脂腺分泌旺盛的情况下，它会大量繁殖。痤疮丙酸杆菌会分解皮脂中的甘油三酯产生游离脂肪酸，这些游离脂肪酸会刺激毛囊及周围组织，导致炎症反应，从而引发囊肿性痤疮。例如，痤疮丙酸杆菌产生的一些酶会破坏毛囊壁，使内容物溢出到周围组织，加重炎症。其他微生物： 马拉色菌等微生物也可能参与囊肿性痤疮的发病过程。马拉色菌在毛囊内大量繁殖时，会引起毛囊的炎症反应，进一步加重痤疮的严重程度。
炎症反应过度：
免疫系统参与： 当毛囊发生堵塞等情况后，局部会引发免疫反应。免疫系统中的中性粒细胞等会聚集到炎症部位，释放炎症介质，如白细胞介素、肿瘤坏死因子等，这些炎症介质会导致毛囊周围组织出现红肿、疼痛等炎症表现，使得痤疮向囊肿性方向发展。炎症反应持续存在且过度时，就容易形成囊肿性痤疮。角质形成细胞异常： 角质形成细胞在囊肿性痤疮的炎症过程中也发挥着作用。异常的角质形成细胞会参与炎症因子的分泌和炎症的维持，进一步加重毛囊周围的炎症状态，促使囊肿性痤疮的形成和发展。