囊肿痤疮主要是由多种因素共同作用引起的。皮脂腺分泌过多是重要原因之一，当皮脂腺分泌过于旺盛时，过多的皮脂会淤积在毛囊皮脂腺内形成脂栓，进而诱发囊肿痤疮。一般来说，青春期人群更容易出现这种情况，因为青春期体内雄激素水平升高，会促使皮脂腺分泌增加。
皮脂腺分泌异常：
皮脂分泌旺盛： 青春期时，体内雄激素水平升高，会刺激皮脂腺增生和分泌，导致皮脂分泌过多。例如，约80% - 90%的青少年在青春期会经历皮脂腺分泌旺盛的阶段，这使得他们相对更容易出现囊肿痤疮。毛囊口角化异常： 毛囊口角化过度会导致毛囊口变小、堵塞，使得皮脂排出受阻。就像管道被堵塞一样，皮脂无法正常排出，就容易在毛囊内积聚形成囊肿痤疮。
细菌感染因素：
痤疮丙酸杆菌繁殖： 毛囊内的痤疮丙酸杆菌大量繁殖，会引发炎症反应。这种细菌会分解皮脂产生游离脂肪酸，刺激毛囊及周围组织，导致局部出现红肿、疼痛的囊肿样损害。研究发现，囊肿痤疮患者皮肤中痤疮丙酸杆菌的数量明显多于正常皮肤。其他细菌影响： 金黄色葡萄球菌等其他细菌也可能参与囊肿痤疮的发病过程，它们会进一步加重炎症反应，使囊肿痤疮的症状更加严重。
炎症反应机制：
免疫炎症参与： 囊肿痤疮的发生涉及复杂的免疫炎症反应。当毛囊堵塞后，局部会启动免疫应答，白细胞等免疫细胞聚集到局部，引发炎症。炎症细胞释放的炎症介质会导致毛囊壁破损、破裂，内容物进入周围组织，从而形成更大的囊肿。炎症持续发展： 如果炎症不能得到及时控制，会持续发展，使得囊肿痤疮的范围扩大、症状加重。长期的炎症还可能导致皮肤组织的纤维化，留下瘢痕等后遗症。
内分泌因素影响：
雄激素水平波动： 除了青春期，女性在月经周期前后，雄激素水平的波动也可能导致皮脂腺分泌增加，诱发囊肿痤疮。部分女性患者会发现，在月经前期囊肿痤疮会明显加重。其他内分泌疾病： 一些内分泌疾病，如多囊卵巢综合征，也会导致体内雄激素水平升高，进而引发囊肿痤疮。患有多囊卵巢综合征的女性中，约有60% - 70%可能会出现皮肤囊肿痤疮的表现。