非淋菌性尿道炎主要由沙眼衣原体、生殖支原体等病原体感染引起，治疗一般选用抗生素，通常7~10天为一个疗程。
常用治疗药物
大环内酯类抗生素： 比如阿奇霉素，它对衣原体、支原体等病原体有较好的抑制作用。还有红霉素，也可用于非淋菌性尿道炎的治疗，能通过抑制细菌蛋白质合成发挥抗菌功效。四环素类抗生素： 像多西环素，可干扰细菌蛋白质合成，从而达到抗菌目的。米诺环素也是常用的四环素类药物，对非淋菌性尿道炎的病原体有一定的抑制作用。
治疗中的注意事项
性伴侣同时治疗： 非淋菌性尿道炎具有传染性，在治疗期间，患者的性伴侣也需要一同检查和治疗，否则容易出现重复感染的情况，影响治疗效果。一般建议在治疗开始前的2~3周内，性伴侣避免性行为。定期复查： 患者在治疗结束后，需要定期进行复查，通常治疗后1~2周需要复查病原体，以确定是否治愈。如果复查结果为阳性，可能需要调整治疗方案。
特殊人群的治疗特点
孕妇患者： 孕妇患非淋菌性尿道炎时，用药需要谨慎。比如阿奇霉素相对较为安全，在医生评估后可以使用。而四环素类药物可能会对胎儿产生不良影响，一般不建议使用。儿童患者： 儿童患非淋菌性尿道炎较为少见，但如果发生，用药需格外小心。通常会选择相对安全的抗生素，如阿奇霉素，且用药剂量需要严格按照儿童的体重等情况进行计算，避免使用可能影响儿童生长发育的药物。
生活中的辅助措施
多饮水： 患者要保证每天充足的饮水量，一般建议每天饮水量在2000毫升以上，通过增加排尿次数，起到对尿道的冲刷作用，有助于减轻尿道的炎症反应，促进病情恢复。保持局部清洁： 要注意保持外生殖器的清洁卫生，每天用温水清洗外阴部，但要避免使用刺激性强的清洁剂。勤换内裤，内裤最好选择棉质、宽松的，以保持局部通风干燥，减少细菌滋生的机会。