小孩夜间磨牙的原因较多，其中约50%与肠道寄生虫有关，比如蛔虫、蛲虫等寄生在肠道内，会分泌毒素刺激神经，导致咀嚼肌痉挛收缩引发磨牙。
一、口腔问题引发
牙齿咬合问题： 如果小孩存在牙齿排列不整齐、牙齿缺损、龋齿等情况，会使牙齿咬合关系不协调，夜间睡觉过程中可能出现磨牙现象。比如有20%左右因牙齿发育异常导致咬合不良的小孩会出现夜间磨牙情况。口腔炎症刺激： 当小孩口腔有牙龈炎、牙周炎等炎症时，炎症会刺激牙龈及周围组织，也可能引起夜间磨牙。比如患有轻度牙龈炎的小孩中，约15%会有夜间磨牙表现。
二、神经系统因素
神经兴奋与抑制失衡： 小孩在白天过度兴奋、紧张、疲劳等，会使大脑皮层兴奋与抑制功能失调，入睡后大脑仍有部分区域处于兴奋状态，可引起咀嚼肌持续收缩，导致夜间磨牙。例如，有些小孩白天参加激烈活动后，夜间磨牙发生率比平时高30%。自主神经功能紊乱： 当小孩自主神经功能紊乱时，也可能出现夜间磨牙。比如处于生长发育期的小孩，自主神经调节能力还不完善，有时会出现这种情况。
三、消化系统原因
晚餐进食不当： 如果小孩晚餐吃得过饱或者进食不易消化的食物，如大量肉类、油炸食品等，胃肠负担加重，夜间睡眠时胃肠仍在消化工作，可能会通过神经反射引起磨牙。有研究显示，约30%晚餐进食过量的小孩会有夜间磨牙现象。肠道功能紊乱： 小孩肠道功能紊乱，如存在积食、便秘等情况，肠道内食物残渣堆积，产生的毒素等刺激肠道神经，也可能传导至口腔引起磨牙。比如有便秘问题的小孩中，约25%会出现夜间磨牙情况。