扁桃体发炎化脓主要是由细菌或病毒感染引起的。其中，A组乙型溶血性链球菌是引发化脓性扁桃体炎最常见的致病菌，约占细菌感染病因的50%左右。
细菌感染导致
链球菌感染： A组乙型溶血性链球菌是引发扁桃体化脓的常见细菌。这种细菌常存在于人的咽部及扁桃体隐窝内，当人体抵抗力下降时，如受凉、过度疲劳等，链球菌就会大量繁殖，侵袭扁桃体，导致扁桃体发炎化脓。例如，在学校、幼儿园等人群密集场所，儿童之间接触密切，容易相互传染链球菌，从而引发扁桃体化脓。葡萄球菌感染： 金黄色葡萄球菌等葡萄球菌也可能引起扁桃体化脓。葡萄球菌可通过空气飞沫、直接接触等途径传播，当它侵入扁桃体后，会引起局部的炎症反应，导致扁桃体红肿、化脓。
病毒感染引发
腺病毒感染： 腺病毒是引起扁桃体发炎化脓的常见病毒之一。腺病毒感染具有一定的季节性，在冬春季节较为多见。感染腺病毒后，扁桃体首先受到影响，出现充血、肿胀，进而可能发展为化脓性炎症。比如，一些儿童在冬季户外活动减少，室内人员密集，容易感染腺病毒，引发扁桃体化脓。EB病毒感染： EB病毒感染也可能导致扁桃体发炎化脓。EB病毒主要通过唾液传播，当人体感染EB病毒后，扁桃体是其常见的侵袭部位之一，会出现扁桃体肿大、充血，表面可能有脓性分泌物。
免疫力低下因素
儿童免疫力特点： 儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，相对较弱，更容易受到病原体的侵袭。例如，3 - 10岁的儿童扁桃体处于发育阶段，免疫力相对较低，当接触到细菌或病毒时，就容易发生扁桃体发炎化脓。而且儿童在幼儿园等集体环境中，接触病原体的机会较多，增加了患病风险。老年人免疫力下降： 老年人随着年龄增长，免疫力逐渐衰退，身体的抵抗力减弱。此时，细菌和病毒更容易侵入扁桃体，引发发炎化脓。另外，一些患有基础疾病的老年人，如糖尿病、慢性阻塞性肺疾病等，免疫力进一步降低，更易出现扁桃体化脓的情况。