扁桃体化脓主要是由细菌感染引起的，其中最常见的致病菌是A组乙型溶血性链球菌，约占化脓性扁桃体炎致病菌的50%左右。
细菌感染是主因
A组乙型溶血性链球菌： 这种细菌很容易在人体抵抗力下降时侵入扁桃体，引发炎症反应，导致扁桃体化脓。比如当人体劳累、受凉后，抵抗力降低，A组乙型溶血性链球菌就容易乘虚而入。金黄色葡萄球菌： 也是导致扁桃体化脓的常见细菌之一。它可以通过飞沫传播等途径进入扁桃体，引发感染，使得扁桃体出现化脓的症状。
自身抵抗力因素
儿童群体： 儿童的免疫系统还在发育阶段，相对较弱，更容易受到细菌侵袭引发扁桃体化脓。比如3 - 10岁的儿童扁桃体处于发育高峰期，这个阶段患病几率相对较高。免疫力低下人群： 像长期患有慢性疾病、长期服用免疫抑制剂的人，他们的身体免疫力较差，抵御细菌的能力减弱，就容易发生扁桃体化脓。例如患有艾滋病的患者，由于免疫系统被破坏，更容易出现各种感染，包括扁桃体化脓。
环境因素影响
季节变化： 在季节交替的时候，气温变化较大，人体容易适应不良，从而降低抵抗力，增加扁桃体化脓的风险。比如春秋季，气温忽高忽低，很多人就容易患上扁桃体化脓。空气污染： 长期处于空气污染较为严重的环境中，空气中的细菌、病毒等病原体增多，会刺激扁桃体，增加扁桃体化脓的发生概率。例如在工业污染严重的地区，居民患扁桃体化脓的几率可能相对较高。