男性不孕不育的主要原因有多种，其中约有50%~60%与精子异常有关。
一、精液异常方面
精子数量问题： 正常男性每次射精精液中精子数量应大于1500万/毫升，如果低于这个数值，就可能影响受孕几率。比如精子数量过少时，与卵子结合的机会就会大大减少。精子活力问题： 精子活力分为a、b、c、d四级，其中a级精子是快速前向运动精子，正常情况下a级精子应大于25%，或a级+b级精子大于50%。如果精子活力低下，像a级精子不足25%，就会影响精子游向卵子并与之结合的能力。
二、生精障碍方面
内分泌因素： 垂体病变可引起促性腺激素分泌不足，从而影响睾丸生精功能。例如垂体瘤患者，可能会出现激素分泌紊乱，进而影响精子的生成。另外，甲状腺功能亢进或减退、肾上腺皮质功能亢进等内分泌疾病，也会通过影响性激素的分泌，干扰生精过程。感染因素： 附睾炎、前列腺炎、精囊炎等生殖系统感染疾病，会影响精子的生成、发育和成熟。比如附睾炎，炎症会破坏附睾内的微环境，影响精子的储存和成熟，导致精子质量下降。
三、输精管道梗阻方面
先天性梗阻： 如先天性输精管缺如、附睾发育不全等，这是由于胚胎发育过程中出现异常导致输精管道不通畅，使精子无法正常排出。后天性梗阻： 附睾结核、淋病等疾病可引起输精管道梗阻。比如附睾结核，结核病变会侵蚀输精管道，造成管道堵塞，阻碍精子运输。
四、免疫因素方面
自身免疫： 男性自身产生抗精子抗体，会导致精子凝集、制动，从而影响精子的活力和受精能力。例如男性生殖系统的外伤、手术等因素可能会导致自身免疫反应的发生，产生抗精子抗体。同种免疫： 女性体内产生抗精子抗体，当有性生活时，女性生殖道接触精子后，会产生免疫反应，杀伤精子，影响受孕。