怀孕初期孕酮低的原因主要有以下几方面：一是黄体功能不足，这可能导致孕酮值甚至低于25ng/ml，此时需去医院检查明确究竟是内分泌疾病、胚胎染色体异常还是其他原因所致，以便进一步治疗；二是甲状腺功能失调，若孕妇甲状腺功能异常，体内会出现胰岛素抗体，进而引起孕酮低；三是生理性因素，因为孕酮作为一种释放性激素，在不同时间测量其数值可能有较大变化。
一、黄体功能不足：
黄体功能出现问题，就会引发这种情况。当发现孕酮值过低时，要尽快到医院进行详细检查，找出具体的引发原因，比如是内分泌方面的问题，还是胚胎自身染色体存在异常等其他因素，然后才能根据具体情况采取针对性的治疗措施。
二、甲状腺功能失调：
孕妇甲状腺功能不正常时，身体内产生胰岛素抗体，从而导致孕酮水平降低。
三、生理性因素：
孕酮是具有释放特性的激素，所以在不同时间进行测量，所得到的数值会有比较明显的波动。
针对怀孕初期孕酮低的情况，治疗方法主要包括以下几方面。
一、生活方面：
1.饮食上，可以多吃富含维生素、豆类和果胶类的食物，以清淡为主，还要多补充叶酸，调节体内分泌。
2.要注意休息，每天坚持适度活动身体，但要避免性行为。
3.保持心情舒畅，不要过度忧郁。
二、药物治疗：
可以服用黄体酮胶囊药物，或者通过肌肉注射来及时补充黄体酮，从而改善孕酮过低的状况。如果情况比较严重，要按照医生的建议进行保胎治疗，最好是卧床休息，避免各类剧烈活动。具体的用药情况一定要严格遵循医师的嘱托。
总结：怀孕初期孕酮低的原因包括黄体功能不足、甲状腺功能失调和生理性因素。治疗方法有生活方面的调节以及药物治疗，要根据具体情况选择合适的治疗方式，同时严格遵循医嘱用药。