怀孕初期孕酮低的原因包括黄体功能不足、甲状腺功能失调以及生理性因素。具体如下：
一、黄体功能不足：黄体功能出现异常时，孕酮值往往较低，甚至在25ng/ml以下，此时需要到医院检查，明确究竟是内分泌疾病、胚胎染色体异常还是其他原因导致的，以便进一步采取治疗措施。
二、甲状腺功能失调：孕妇甲状腺功能失调后，体内会产生胰岛素抗体，进而导致孕酮降低。
三、生理性因素：孕酮作为一种释放性激素，在不同时间测量，其数值可能有较大变化。
针对怀孕初期孕酮低的治疗方法有：
1.生活方面：多吃富含维生素、豆类和果胶类食物，饮食以清淡为主，多补充叶酸，调节体内分泌；注意休息，每天坚持适当走动以活动身体；避免性行为；保持心情舒畅，不要过度忧郁。
2.药物治疗：可服用黄体酮胶囊药物或进行肌肉注射来及时补充黄体酮，以调整孕酮过低的情况。如果情况过于严重，需根据医生建议进行保胎治疗，最好卧床休息，避免各类剧烈活动。具体用药需严格按照医师嘱托。
总结概况提示：怀孕初期孕酮低可能由多种原因引起，要明确具体原因并采取相应的治疗方法，包括生活调理和药物治疗，且用药应遵循医嘱。