肛瘘的主要治疗方式就是手术，且临床上手术方法多样，包含肛瘘切开术、肛瘘切除术、挂线疗法以及括约肌保留术式等。但不存在哪种方法绝对更好的说法，需依据患者具体状况选择适宜的手术方法，合适的才是最佳的。
一、肛瘘切开术：主要适用于低位肛瘘患者。该术式是将瘘管切开，进而清除其中的坏死组织。采用此方法后，患者通常不会出现严重的肛门失禁情况。
二、肛瘘切除术：就是把瘘管壁完全切除掉。适用于低位单纯性肛瘘或高位肛瘘结构中瘘管成熟的较低部分，其创伤相对瘘管切开术要大一些。
三、挂线疗法：这是一种传统的肛瘘治疗手段，主要针对距离肛门3厘米至5厘米且有内外口的低位或高位单纯性肛瘘。其原理是利用橡皮筋穿过肛瘘的内外口，借助橡皮筋的回缩力来阻断结扎侧的血液循环，之后再慢慢切开，从而促使另一侧和瘘管闭合。
四、保留括约肌的手术：涵盖经括约肌间切开术（TROPIS）、松弛挂线术、经括约肌瘘管结扎术（LIFT）等。
总结概况提示：肛瘘治疗手术方法多样，每种方法都有其适用情况，应根据患者具体病情选择，以达到最佳治疗效果。