结石的治疗方式需根据结石的部位、大小等情况来定。一般来说，对于直径小于0.6厘米的肾结石，可通过大量饮水等方式促进排出。而对于不同部位的结石，治疗方法有所不同。
肾结石的常见治疗
对于较小的肾结石，首先建议增加饮水量，每天应达到2000 - 3000毫升以上，这样能增加尿量，帮助结石排出。如果疼痛明显，可使用非甾体抗炎药如双氯芬酸等缓解疼痛，但要在医生指导下使用。对于较大的肾结石，可能需要体外冲击波碎石，利用高能冲击波聚焦后击碎结石，使其随尿液排出。
输尿管结石的治疗
输尿管结石的治疗也与结石大小有关。直径小于0.4厘米的输尿管结石，有很大可能自行排出，同样需要大量饮水辅助。如果结石较大，可考虑输尿管镜取石术，通过输尿管镜进入输尿管，找到结石后取出。另外，对于一些特定情况的输尿管结石，也可采用体外冲击波碎石，但要评估结石位置等情况是否适合。
膀胱结石的治疗
膀胱结石的治疗方式取决于结石大小。较小的膀胱结石可通过膀胱镜下碎石取石术，利用器械将结石粉碎后取出。而较大的膀胱结石可能需要开放手术取石。同时，对于因前列腺增生等导致膀胱结石的患者，还需要处理原发疾病，以防止结石复发。
胆囊结石的治疗
对于无症状的胆囊结石，可定期观察，注意饮食控制，避免高脂肪、高胆固醇食物摄入。而对于有症状的胆囊结石，如经常出现右上腹疼痛、恶心等，通常建议行腹腔镜胆囊切除术，这是一种比较成熟的手术方式，创伤小，恢复快。如果患者身体状况不适合手术，也可考虑药物溶石，但药物溶石效果有限且疗程长。