胃肠感冒通常可以使用对症治疗的药物来缓解症状，一般常用的有缓解感冒症状的药物以及调节胃肠道功能的药物等。比如可以用含有解热镇痛成分的药物来缓解发热、头痛等症状，用调节胃肠动力的药物来改善胃肠道不适。
缓解症状类药物
退热止痛类： 如果胃肠感冒患者有发热、头痛、肌肉酸痛等症状，可以使用对乙酰氨基酚等药物来退热止痛。对乙酰氨基酚能通过抑制前列腺素的合成，达到解热镇痛的效果，一般用于缓解轻至中度疼痛以及普通感冒或流行性感冒引起的发热。缓解鼻塞流涕类： 若有鼻塞、流涕等症状，可使用氯苯那敏等抗组胺药物。氯苯那敏能竞争性阻断组胺H₁受体，减轻过敏症状，缓解鼻塞、流涕等情况，但可能会引起嗜睡等不良反应，用药后要避免驾驶车辆等需要高度集中注意力的活动。
调节胃肠道功能类药物
止泻类： 当胃肠感冒出现腹泻症状时，可使用蒙脱石散。蒙脱石散对消化道内的病毒、细菌及其产生的毒素有固定、抑制作用，同时对消化道黏膜有覆盖保护能力，能吸附肠道内的病原体和毒素，起到止泻的作用。成人及儿童都可使用，但要注意按正确剂量服用，避免过量导致便秘等问题。调节肠道菌群类： 可以使用双歧杆菌四联活菌片等调节肠道菌群的药物。这类药物含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等有益菌，能补充肠道有益菌，抑制有害菌的生长，调节肠道菌群平衡，改善胃肠感冒引起的肠道功能紊乱。
抗病毒类药物
常用抗病毒药： 如果是由病毒感染引起的胃肠感冒，在病程早期可以考虑使用利巴韦林等抗病毒药物。利巴韦林能抑制病毒核酸的合成，发挥抗病毒作用，但使用时要注意其可能存在的不良反应，如贫血、乏力等，而且孕妇禁用。不过一般来说，胃肠感冒大多是自限性疾病，症状较轻的患者不一定需要常规使用抗病毒药物，主要还是以对症治疗为主。需要注意的是，儿童使用药物时要格外谨慎，比如2岁以下儿童使用含解热镇痛成分药物需在医生指导下进行，且要严格按照儿童剂量使用。同时，胃肠感冒患者在用药的同时，还要注意休息，多喝水，饮食要清淡易消化，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，以免加重胃肠道负担。如果症状严重或持续不缓解，应及时就医，不要自行盲目用药。