六岁儿童发烧39℃，可通过以下方法来处理：
一、使用退烧药
六岁儿童发烧39℃时，一般可在医生指导下口服对乙酰氨基酚口服溶液或布洛芬混悬液等退烧药，以实现紧急退烧的目的。与此同时，还要注意让孩子多喝温开水，这样能促进排汗，进而有助于退烧。
二、物理降温
在服用退烧药后，如果体温没有迅速上升，并且孩子没有哭闹或寒战等情况，通常可以采取洗温水澡、贴退热贴或者温水擦浴等方式来进行物理降温。
1.洗温水澡：通过温水的作用来帮助散热。
2.贴退热贴：可贴在孩子额头等部位，起到一定降温作用。
3.温水擦浴：用温水擦拭孩子身体的某些部位，促进热量散发。
三、针对病因治疗
六岁儿童发烧39℃的原因有很多，需要针对具体病因进行治疗。比如若是支原体感染且清除不彻底而导致的高烧，可在医生指导下，按足疗程使用阿奇霉素等药物进行治疗。
总之，六岁儿童发烧39℃时，应及时前往医院就诊，明确病因后进一步采取相应的治疗措施。