治疗肠炎的药有多种，常见的包括益生菌类药物、抗生素类药物等。比如益生菌类药物中，枯草杆菌二联活菌颗粒就是常用的，它能调节肠道菌群，一般对肠道菌群失调引起的肠炎有一定作用。
一、益生菌类药物
枯草杆菌二联活菌颗粒： 主要含有枯草杆菌和肠球菌，可直接补充正常生理菌丛，抑制致病菌，促进营养物质的消化、吸收，抑制肠源性毒素的产生和吸收，达到调整肠道内菌群失调的目的。适用于因肠道菌群失调引起的肠炎等肠道疾病。需注意，服用时水温不宜超过40℃，避免破坏活菌活性。双歧杆菌三联活菌胶囊： 含有长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌，在肠道内形成生物屏障，抑制肠道中某些致病菌，促进肠道蠕动，调整肠道菌群平衡。用于治疗肠道菌群失调引起的肠炎、腹泻等。该药物应冷藏保存，以保证活菌活性。
二、抗生素类药物
诺氟沙星胶囊： 属于喹诺酮类抗生素，适用于敏感菌所致的肠道感染，如肠炎、痢疾等。但需要注意的是，18岁以下的人群禁止使用诺氟沙星，因为可能会影响骨骼发育。它通过抑制细菌DNA旋转酶的活性，阻碍细菌DNA复制，从而达到杀菌作用。头孢克肟分散片： 是第三代头孢菌素类抗生素，对多种细菌感染引起的肠炎有疗效。它可阻止细菌细胞壁的合成，使细菌迅速破裂溶解。不过，使用前需要确认患者不对头孢类药物过敏，且用药期间可能会出现腹泻、恶心、呕吐等不良反应。
三、止泻收敛类药物
蒙脱石散： 具有层纹状结构及非均匀性电荷分布，对消化道内的病毒、病菌及其产生的毒素有固定、抑制作用，对消化道黏膜有覆盖能力，并通过与黏液糖蛋白相互结合，从质和量两方面修复、提高黏膜屏障对攻击因子的防御功能。可用于成人及儿童急、慢性肠炎引起的腹泻。服用时需注意，要将蒙脱石散倒入50毫升温水中摇匀服用，且需空腹服用，同时与其他药物服用应间隔一段时间，以免影响药效。药用炭胶囊： 能吸附导致肠炎腹泻的气体、细菌及其产生的毒素等，从而起到止泻作用。用于食物及生物碱等引起的中毒及腹泻、腹胀等。但长期服用可能会引起便秘，所以不宜大量或长期服用。