小孩屁眼痛可能由多种原因引起，比如肠道寄生虫感染，像蛔虫、蛲虫等感染肠道后，可能会导致肛门周围不适、疼痛，其中蛲虫常在夜间爬出肛门产卵，刺激肛门周围皮肤，引起剧烈瘙痒和疼痛。
肠道寄生虫感染导致
蛲虫感染： 蛲虫比较小，通常夜间会爬到肛门外产卵，这时候小孩会感觉屁眼特别痒，忍不住去抓，抓挠后就可能导致屁眼疼痛。一般多见于儿童群体，尤其是卫生习惯不太好的孩子容易感染。蛔虫感染： 蛔虫在肠道内寄生，当蛔虫数量较多或者活动时，也可能影响肠道功能，偶尔会导致肛门周围有不适感觉，严重时也会引起屁眼痛。
局部皮肤问题导致
尿布皮炎： 如果小孩长时间使用尿布，局部皮肤不透气，尿液、粪便刺激皮肤，就容易引发尿布皮炎，出现屁眼周围皮肤发红、疼痛等症状。尤其是在炎热的天气里，这种情况更常见，一般持续使用尿布且护理不当就可能发生。湿疹： 小孩屁眼周围的皮肤比较娇嫩，若接触到某些过敏原，或者局部潮湿等，容易引发湿疹，表现为屁眼周围皮肤瘙痒、红斑、疼痛等。比如对尿布材质过敏，就可能出现这种情况。
肛肠疾病导致
肛裂： 小孩如果大便比较干结，排便时过于用力，就可能导致肛管皮肤裂开，引起屁眼疼痛，同时可能伴有便血。一般干结的大便刺激是常见诱因，比如有的孩子好几天才排一次大便，就容易出现肛裂导致屁眼痛。肛瘘： 相对来说比较少见，但也可能发生，肛瘘是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，会导致屁眼周围反复流脓、疼痛等症状。通常是由于肛周脓肿破溃等原因引起。