肩胛骨酸痛的治疗方式需根据具体病因来定。一般来说，若因肌肉劳损导致的肩胛骨酸痛，可通过休息等方式缓解。而对于一些因疾病引起的肩胛骨酸痛则需要针对性治疗。
物理治疗缓解
热敷： 可以用热水袋或热毛巾进行局部热敷，每次热敷15 - 20分钟，每天可进行3 - 4次。热敷能促进局部血液循环，缓解肌肉紧张，减轻酸痛感。按摩： 找专业的按摩师进行肩部按摩，按摩师会通过揉、按、捏等手法放松肩胛骨周围的肌肉。比如重点按摩斜方肌、冈上肌等部位，每次按摩时间控制在20 - 30分钟，每周可进行2 - 3次。但如果是肩部有急性损伤，如骨折、脱位等情况则不能按摩。
运动康复改善
拉伸运动： 进行肩部的拉伸练习，像站立位拉伸，双脚与肩同宽，将一侧手臂向上伸直，然后用另一侧手臂轻轻拉向身体，保持15 - 30秒，再换另一侧。每天进行3 - 4组，每组每个方向拉伸2 - 3次。还有坐姿拉伸，坐在椅子上，将一只手臂弯曲放在胸前，用另一只手拉住肘部向身体方向拉，同样保持15 - 30秒后换另一侧。康复锻炼： 进行肩部的稳定性锻炼，例如靠墙俯卧撑。面对墙壁站立，距离墙壁约30 - 40厘米，双手撑在墙上，与肩同宽，慢慢做俯卧撑动作，每次做10 - 15个，每天3 - 4组。但如果肩部有炎症急性期，如肩袖炎急性发作期，要避免过度的运动康复锻炼。
药物辅助治疗
非甾体抗炎药： 像布洛芬等非甾体抗炎药可以缓解肩胛骨酸痛带来的炎症和疼痛。不过这类药物可能会有一些副作用，比如对胃肠道有刺激，所以不建议长期大量服用。一般是在酸痛比较明显影响生活时短期使用，服用时要按照药物说明书的剂量来，并且最好在饭后服用以减少对胃的刺激。外用药物： 可以使用一些外用的膏药，如氟比洛芬凝胶贴膏等。将膏药贴在肩胛骨酸痛的部位，它能通过皮肤吸收发挥抗炎止痛的作用。一般每天贴1次，每次贴12小时左右，但如果皮肤有破损、过敏等情况则不能使用外用膏药。
就医检查与治疗
如果肩胛骨酸痛持续时间超过2周，或者伴有手臂麻木、无力、肩部活动明显受限等情况，就需要及时就医。医生可能会进行肩部的X线、CT或磁共振成像（MRI）等检查，以明确病因。如果是肩周炎引起的肩胛骨酸痛，在急性期可能会进行局部的封闭治疗等；如果是由于颈椎病压迫神经导致的肩胛骨酸痛，可能需要进行牵引、理疗等综合治疗。