骨髓增生异常综合征有一定的治愈可能，但具体情况因人而异。部分低危组患者通过治疗有机会实现临床缓解甚至治愈，比如约20% - 30%的低危骨髓增生异常综合征患者经规范治疗后可达到长期生存且病情稳定。
治疗方式影响预后
化疗药物： 对于低危组患者，可使用来那度胺等药物治疗，能调节免疫等，改善病情。而高危组患者常需采用类似急性白血病的化疗方案，如阿糖胞苷联合蒽环类药物化疗，但高危组患者预后相对较差。造血干细胞移植： 对于年龄合适、有合适供体的患者，异基因造血干细胞移植是可能治愈骨髓增生异常综合征的方法，尤其是年轻的高危患者，移植后有一定比例可获得长期无病生存。但移植存在一定风险，如移植相关并发症等，约有30% - 50%的患者能成功进行移植且获得较好效果。
病情分型差异
低危型： 包括难治性贫血等，病情进展相对缓慢，患者可能有血细胞减少，但通过药物治疗等，部分患者可以维持较长时间的病情稳定，甚至有治愈的可能。比如难治性贫血患者，经过规范的来那度胺等药物治疗，部分患者能够改善造血功能，达到临床缓解。高危型： 如难治性贫血伴原始细胞增多 - 转变型等，病情进展快，更容易向急性白血病转化，预后相对较差。但通过积极的化疗等治疗，部分患者可缓解病情，为后续造血干细胞移植创造条件。
患者自身状况影响
年龄因素： 年轻患者身体状况较好，对治疗的耐受性相对较强，在接受造血干细胞移植等治疗时，成功的几率相对较高，治愈的可能性也更大。而老年患者身体机能下降，对化疗等治疗的耐受性差，治疗相关风险更高，预后相对低危组年轻患者要差一些。一般状况： 患者的一般状况良好，如肝肾功能正常、营养状况佳等，更能耐受治疗，治疗效果也相对较好，治愈的可能性相对更高；反之，一般状况差的患者，治疗耐受性差，预后也会受到影响。