反流性食管炎和反流性胃炎都是由于胃内容物反流引起的消化道疾病，但它们有明显区别。反流性食管炎是胃十二指肠内容物反流入食管引起的食管黏膜炎症，而反流性胃炎是十二指肠内容物反流入胃引起的胃黏膜炎症。
病变部位不同
反流性食管炎： 病变主要在食管。食管下段括约肌功能障碍等原因导致胃酸等反流至食管，长期刺激可引起食管黏膜的糜烂、溃疡等病变。反流性胃炎： 病变部位主要在胃。是含有胆汁、胰液等的十二指肠内容物反流进入胃内，从而损伤胃黏膜。
症状表现有差异
反流性食管炎： 最典型的症状是烧心和反流，烧心是胸骨后烧灼感，常由胸骨下段向上延伸，多在餐后1小时左右出现；反流是指胃内容物在无恶心和不用力的情况下涌入咽部或口腔的感觉。部分患者还可能有吞咽困难、胸痛等症状，吞咽困难可呈间歇性，严重时可为持续性。反流性胃炎： 主要症状有上腹部疼痛，疼痛多无规律，可为隐痛、胀痛或烧灼样痛；还可伴有腹胀、恶心、呕吐等症状，呕吐物中可能含有胆汁，患者常感口苦。
检查方法有别
反流性食管炎： 胃镜检查是诊断反流性食管炎最准确的方法，能直接观察食管黏膜的病变情况，如有无糜烂、溃疡等，并可进行活检。24小时食管pH监测也是重要的检查手段，可了解食管内酸碱度变化，明确有无过多的酸反流。反流性胃炎： 胃镜检查是主要的诊断方法，可直接看到胃黏膜有胆汁反流的表现，如胃黏膜呈黄染、水肿等。胃吸出物测定也是一种检查方式，通过测定空腹和餐后胃液中的胆酸含量，来判断有无胆汁反流。